昆明植物所利用第二代高通量测序仪首次解析麻竹花转录组
中国科学院昆明植物研究所郭振华研究组和李德铢研究组多年来致力于竹子的繁殖和开花机理研究。最近,利用高通量的Illumina GAII测序平台,研究人员对木本竹种麻竹(Dendrocalamus latiflorus)不同发育时期的花组织进行了转录组测序。测序共产生了约96,000,000个reads,经de novo从头组装后共得到了146,395个高质量的unigene,平均长度为461 bp。
Nat Commun:新筛选方法鉴定出相互作用的小分子与RNA基序
2012年10月10日 讯 /生物谷BIOON/ --来自美国佛罗里达州斯克里普斯研究所的研究人员开发出一种新的方法来筛选RNA与小分子之间的三百万多种相互作用的组合以便鉴定出RNA上的最佳作用靶标和最有前途的潜在药用化合物。这种新技术可能导致人们开发出更加有效的药物。
:微生物所在筛选群体感应抑制剂方面取得新进展
在自然界中,很大一部分的微生物以生物膜的形式生存,使其可以抵抗临床抗生素以及人体免疫系统的清除。常规抗生素可以杀死浮游菌和表层菌,临床症状可以得到缓解,但生物膜内的细菌很难被清除掉,在停止用药后生物膜内残存的菌体会迅速繁殖,使得感染症状再次复发,长期反复治疗过程中抗生素的大量使用,导致耐药菌株不断产生,给治疗带来了更大的难题。因此,新靶点药物的开发为治疗细菌感染带来新的希望。
PLOS ONE: IGF信号通路抗体芯片筛选出肝癌靶生物标志物
2012年10月18日 讯 /生物谷BIOON/ --肝癌是全球六大常见癌症和三大致死性癌症之一。 肝癌的恶性转移主要由几个原因介导的,特别是IGF及其配体、受体、底物、和配体结合蛋白。IGF信号通路通过与细胞表面上特异性受体结合的形式在调节细胞增殖、分化、凋亡等方面起着非常重要的生理作用。
:一种信息学算法快速筛选肿瘤特异抗原的方法
2012年11月14日讯 /生物谷BIOON/ 近日,由北京大学医学部免疫学系的研究人员和美国贝勒医学院合作,在筛选肿瘤特异抗原方面取得重要成果。最新代表性研究论文于近日在线发表在《癌症研究》(Cancer Research)上。 肿瘤特异抗原(Tumor-specific antigen, TSA)具有在正常组织低表达,而在肿瘤组织中高表达的特点,对肿瘤的早期诊断和肿瘤免疫治疗都十分关键。
帝肯与复旦大学合作成立示范实验室 助力药物筛选研究
上海 2012年11月8日 电 /生物谷BIOON/ --10月30日早上11点,复旦大学药学院与瑞士帝肯(Tecan)集团公司正式宣告成立“复旦大学药学院-瑞士帝肯示范实验室”。
Nat Chem Biol:筛选出调节机体代谢过程的活性化合物
2012年12月3日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,刊登在国际杂志Nature Chemical Biology上的一篇研究报告指出,研究者开发出了一种斑马鱼,当其肝脏产生葡萄糖的时候,其就会由半透明变成绿色,这或许帮助研究者来鉴别调节整个机体代谢的化合物,或许也可以保护肥胖小鼠免于代谢性疾病的困扰。
JMD:新方法筛选非小细胞肺癌的ALK融合
2012年12月14日讯 /生物谷BIOON/ --大约20例非小细胞肺癌(NSCLC)患者中有一例间变性淋巴瘤激酶(ALK)基因染色体畸变,这些患者对ALK-激酶抑制剂如Crizotinib治疗高度敏感。然而,目前的诊断测试有其局限性。 研究人员已经开发并测试了一种有前途的新方法筛选非小细胞肺癌的ALK融合。新研究提供了一个成本效益和易于执行的新测试方法。
PLoS:离子通道活性化合物筛选平台
来自上海药物所等处的研究人员采用基于荧光的筛选技术,搭建了离子通道活性化合物筛选平台,并从中发现多个活性化合物,比如KCNQ1激动剂六氯酚(Hexachlorophene),相关研究成果公布在PLOS ONE杂志上。 文章的通讯作者分别是上海药物所利民特聘研究员和高召兵博士,第一作者为研究生郑月明。
Cancer Res:肿瘤特异性抗原筛选新方法
来自北京大学医学部的研究人员与美国贝勒医学院等单位合作,在筛选鉴定肿瘤特异性抗原方面取得重要进展,其主要研究成果发表在最新一期的国际著名杂志《癌症研究》(Cancer Research)上。 肿瘤特异性抗原是一类在肿瘤组织中特异性高表达,而在所有或者大多数正常组织中不表达或低表达的蛋白。很多肿瘤特异性抗原已经被用于对肿瘤的早期诊断,预后评估以及被作为肿瘤治疗的靶点。