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EMBO Reports丨钟国华团队揭示果蝇卵巢生殖干细胞单细胞转录特征及eggplant调节分化发育潜在机制

果蝇卵巢生殖干细胞(germline stem cell,简称GSC)是干细胞生物学研究的理想模型【1】,其增殖与分化受细胞内在调控因子和微环境信号共同作用。许多参与调控GSC的内源基因与哺乳动物干细

2023-08-24

科研人员提出环形RNA全长转录解析技术

近年的研究表明,环形RNA在真核生物体内具有广泛的生物学功能。由于环形RNA序列与线性RNA相似度高,因此如何高效鉴定环形RNA特有的外显子结构,是环形RNA研究中的重要问题。

2023-04-21

Nature:中美科学家联袂揭示启动小鼠合子基因组激活的关键转录因子

在一项新的研究中,来自中国清华大学和美国加州大学戴维斯分校的研究人员发现受精卵细胞---称为合子(zygote)---如何进行“重置”,从而使新形成的胚胎能够按照自己的遗传程序

2023-07-28

新研究揭示逆转录转座子劫持宿主细胞的修复机制形成环状DNA

和病毒一样,一种有点寄生的称为逆转录转座子(retrotransposon)的DNA序列被发现借用细胞自身的机制来实现它本身的目标。

2023-07-25

迄今最大规模研究破解持久性CAR-T细胞转录组特征

Ghorashian团队认为,他们这个研究最重要的发现是发现了持久性CAR-T细胞的独特转录特征。而且这个特征在不同人群、不同CAR-T疗法中也存在。因此这暗示着,这种独特的转录特征有可能代表了持久性

2023-07-14

Advanced Science:韩敬东团队开发转录组数据空间重构新算法

该研究建立了一种单细胞/寡细胞转录组数据从头空间重构算法——De Novo Coalescent Embedding(D-CE)。该研究利用细胞-细胞转录相关网络的非线性嵌入方法,从头重构了单细胞转录

2023-06-21

Cell:揭示对大多数基因而言,转录开始位点决定了转录结束位点

我们DNA中的每个基因都有开始和结束。正确确定基因的开始和结束对于产生功能性蛋白至关重要。人们已做了大量的研究来确定是什么决定了一个基因何时、何地以及在DNA的哪个位点“开始”

2023-05-31

研究揭示拟南芥RNA聚合酶V的转录延伸机制

Pol V-KTF1转录延伸复合物的冷冻电镜结构显示,Pol V具有和Pol II类似的活性中心,但Pol V活性中心的结构单元和Pol II具有构象差异。

2023-06-06

空间转录组数据多模态可视化工具研究取得进展

目前已有工具可以将二维切片的基因表达模式进行可视化,或者进一步堆叠多张切片并形成组织的三维静态视图,但在三维空间中对空间转录组数据的分子特征和空间形态进行交互式探索仍然是一个难点。

2023-06-05

Nature:揭示组蛋白修饰调节先锋转录因子协同性结合机制

就像紧紧缠绕在线轴上的线一样,DNA被包裹在组蛋白上,并被包装成称为核小体的结构。在一项新的研究中,来自美国圣犹达儿童研究医院的研究人员探索了一种被称为先锋转录因子(pioneer transcrip

2023-05-30