Science：利用单细胞染色质可及性图谱揭示原发性人类癌症中的恶性调控程序
多种人类原发性癌症类型的 TCGA 单细胞图谱和用于解释癌症中顺式调控元件的可解释深度学习模型，为了解导致原发性人类癌症恶性表型的分子程序提供了新的资源。
2024-09-27
Cell Metab | 吕志民团队阐述Warburg效应通过乳酰化调控DNA损伤修复的机制
该评述指出，Warburg效应不仅仅是一个代谢现象，其对多种非代谢细胞活动具有关键影响。糖酵解中的代谢酶和代谢物往往具有“多重功能”，可以通过代谢以及非代谢依赖的方式改变肿瘤细胞的各种重要活动。
2024-08-08
Nat Commun ：哺乳动物活细胞内可编程重构RNA调控网络的人工基因线路
研究团队首次将原本不可检测的单点突变RNA感应由1.5倍提升至94倍。由此，成功实现单碱基突变的检测，也将RNA表达量的感应扩展至序列变化的感应，极大地丰富了RNA-IN模块的识别范围。
2024-11-02
Nature子刊：浙大熊旭深团队开发基于Transformer的语言模型，预测翻译调控并解析疾病变异
该深度学习模型Translatomer为领域提供了研究基因翻译调控的新工具，还为解释复杂疾病中的遗传变异提供了除了mRNA水平之外的重要机制基础。
2024-11-01
Nature Genetics：基因调控的精准地图：ChIP-DIP技术开启蛋白质-DNA相互作用的新纪元
ChIP-DIP技术的出现，为基因调控的研究打开了一扇全新的大门。通过并行分析多个蛋白质-DNA相互作用，ChIP-DIP不仅显著提高了研究效率，还揭示了基因调控网络的复杂性和动态性。
2024-12-05
Nature Genetics：基因调控的精准地图——ChIP-DIP技术开启蛋白质-DNA相互作用的新纪元
通过将多种蛋白质与DNA的结合关系同时映射，ChIP-DIP 为我们提供了一个全新的视角，使得研究人员可以在一个实验中并行检测多个蛋白质的DNA结合模式，从而更加全面、精确地揭示基因调控的动态变化。
2024-12-09
Chin Med：白头翁经ERK通路调控LDLR实现降脂新功效
研究表明白头翁可作为新型降血脂药，其通过ERK依赖途径上调LDLR，调节脂质代谢通路，降低血清胆固醇与LDL胆固醇、改善脂肪肝，且PCD是其发挥作用的主要活性成分。
2025-01-09
Nature子刊：董晨团队揭示CD8+T细胞活化的三维基因组调控机制
本研究不仅揭示了 TRIM28 在 CD8+ T 细胞活化中的关键作用，还为开发针对肿瘤和感染的新型免疫治疗策略提供了潜在靶点。
2025-01-25
Nat Rev Genet | 周琦团队探讨动物性染色体独特的演化调控模式
性别决定基因在物种间频繁的颠换也是造成性染色体系统多样性的原因之一，本文进一步讨论了这一现象背后的潜在机制。
2024-08-04