Nat Biotechnol:新型计算方法CoNGA为预测T细胞行为奠定基础
研究人员开发出一种称为CoNGA的新型计算方法,它可能有助于人们关注将T细胞受体(TCR)基因序列和T细胞功能相关联在一起的隐藏生物模式。此外,利用CoNGA,他们可以分析从单个T细胞中收集到的复杂数据,以揭示新的T细胞群体,并揭示塑造T细胞发育的TCR特征。
Nat Biotechnol:新方法可选择性扩增识别人类实体瘤新抗原的肿瘤浸润性T细胞用于癌症治疗
在一项新的临床前研究中,来自瑞士洛桑大学和洛桑大学医院的研究人员设计了一种高效产生大量免疫细胞的方法,所产生的免疫细胞专门用于识别新抗原---通常是患者所患癌症所特有的随机突变蛋白的小片段,并摧毁表达它们的肿瘤。他们开发的这种方法被命名为NeoScreen,极大地改善了对患者新抗原的识别,因此开发针对癌症的个性化免疫疗法具有相当大的前景。
科学家开发利用负压递送DNA疫苗的方法,可促进疫苗快速、高效响应
近二十年来,以RNA、DNA为基础的各种核酸药物和疫苗开始大放异彩,尤其是在最近的新冠疫情中,mRNA疫苗实在是风头无两,不由得让大家对核酸疫苗的未来充满期待。核酸与其他药物成分最大的不同在于,它需要在细胞内起效,因此如何将核酸递送至细胞质和细胞核的转染(transfection)就显得至关重要了。近期,《科学进展》杂志发表了一项来自罗格斯大学科
科研人员开发全新的药物-药物相互作用事件预测方法
近日,上海交通大学生命科学技术学院魏冬青课题组在生物信息学顶级刊物《Briefings in Bioinformatics》(IF:11.622)上发表题为“MDF-SA-DDI: predicting drug–drug interaction events based on multi-source drug fusion, multi-source f
Science:解析出人脑细胞受体GPR158的三维结构图,有助于开发治疗抑郁症和焦虑症的方法
在一项新的研究中,来自美国斯克里普斯研究所的研究人员利用超冷单粒子电子显微镜(低温电镜)以大约十亿分之一米的分辨率解析出一种名为GPR158的不寻常的脑细胞受体及其与一组介导其活性的蛋白结合在一起时的原子结构图。
研究提出新方法重塑史前人类基因交流与演化模型
《自然-通讯》(Nature Communications)在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所/复旦大学徐书华团队题为Refining models of archaic admixture in Eurasia with ArchaicSeeker 2.0的研究论文。该工作提出了基于隐马尔科夫模型(Hidden Markov Model)
RNA修饰方法学取得重要进展
RNA被认为是生命出现伊始就存在的生物大分子。漫长的演化历程中,RNA逐渐从生命信息存储和表达的双重身份中特化出来,成为传递信息的媒介。处在中心法则中间的RNA,即不像DNA存储遗传信息,也不像蛋白质直接体现生命活动,只有以少数特例存在的形式下,如病毒、核酶,还提醒人们它仍然保留来自远古的使命。近年来,表观转录组学(epitranscriptomics)学说
科研人员建立靶向RNA的病原检测新方法
病原感染是威胁人类健康的问题,对临床诊断和治疗造成负担。临床上,传统的病原鉴定主要以培养和生化检测为基础,但随着下一代测序技术的不断进步,宏基因组测序(mNGS)提高了病原检测的效率,并有助于识别难以培养的病原微生物;测序识别抗生素抗性微生物也为改善治疗方案提供了依据。然而,mNGS在临床应用方面仍面临障碍,尤其是当检验样品总量少、样
科研人员发展出高血压预警新方法
近期,中国科学院合肥物质科学研究院智能机械研究所发展出一种“基于简易风险因素的高血压风险评估方法”,通过易于获得的生活方式信息和人体测量学信息,准确评估个体的高血压患病风险,具有低成本、易操作、易普及的特点,目前已广泛应用于运动与健康研究中心建设的多个示范应用基地。该方法可早期识别高血压高风险人群,实现有限预防资源的高度聚
上海药物所罗成课题组开发可高通量化的5mC/m6A修饰酶的酶活检测方法
DNA甲基化(5mC)和RNA甲基化(m6A)广泛存在于动植物、真菌以及原核生物中,在多种生命进程中扮演着重要角色【1、2】。调控5mC/m6A水平的修饰酶包括甲基转移酶DNMTs、METTL3/METTL14及去甲基化酶TETs、FTO、ALKBH5等。诸多研究表明,这些修饰酶与多种疾病发生发展密切相关,是重要的潜在疾病治疗靶点,具有极大的临床价值【3-1