研究人员利用计算推动微生物转氨元件发掘与氨基酸高效利用
近年来，合成生物学的快速发展使微生物发酵生产天然氨基酸的成本持续降低，氨基酸产业取得了巨大发展。然而，我国作为氨基酸生产和消费大国，大宗型氨基酸产品已经进入供过于求的状态。因此，发展使用生物基L-氨基酸作为初始原料生产高附加值产品的新型生物技术，对可持续性发展与产业升级具有重要意义。酮酸作为L-氨基酸合成的直接前体物质，在人体和动物的新陈代谢中起
利用超级计算机发现125种可能对抗COVID-19的天然化合物
2020年6月22日讯 /生物谷 BIOON /——美国阿拉巴马大学亨茨维尔分校(UAH)的Baudry实验室从超级计算机快速评估的首批5万种天然化合物中鉴定出125种具有抗COVID-19病毒的潜力的化合物。这是首次使用超级计算机评估天然化合物对COVID-19产生的蛋白质的治疗效果。该实验室位于UAH的Shelby科技中心，目前正在使用惠普公司(HPE)
科学家如何利用世界上最强大的计算机来帮助理解和阻断SARS-CoV-2的感染？
2020年6月18日 讯 /生物谷BIOON/ --在道格拉斯-亚当所著的《银河系漫游指南》中，傲慢的超级计算机“深思”为问及能否找到关于生命、宇宙和万物的终极问题的答案，他的回答是，能做到但非常棘手，当被问及多长时间时，他的回答是七百五十万年。现实生活中的超级计算机似乎也会被问到一些并不那么宽泛但却很棘手的问题，即如何应对COVID-19的大流行，其能被应
Science：呼吁建模科学家们快速发布用于评估和预测COVID-19疫情的模型和代码
2020年5月4日讯/生物谷BIOON/---越来越清楚的是，根据所使用的计算机模型，我们要么仍然处于疫情大爆发之中，病例和死亡人数不断增加，要么即将接近让社会恢复正常运作的时间。为什么会有这样的差距？这是因为每种模型的工作原理有点不同，而且根据所使用的模型和加入的假设，结果会发生变化，有时会有很大的变化。如今，31位计算机建模科学界的领军人物呼吁开放交换用
WHO：科学家利用超级计算机模拟成功找到能有效抵御COVID-19的潜在活性物质
2020年5月9日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，一篇发表在World Health Organization网站上的研究报告中，来自美茵茨大学等机构的科学家们通过研究发现，被批准用于治疗丙肝的多种药物或能作为抵御COVID-19的潜在候选药物，COVID-19是由SARS-CoV-2冠状病毒感染所诱发的疾病。图片来源：NIAID这项研究中，研究人员模
PeerJ: 计算机模拟揭示癌症多样性
2020年5月1日讯/生物谷BIOON/---近日，由贝勒医学院的研究人员领导的在《the Lancet Oncology》杂志上发表的研究中，作者们开创了一种创新的局部化疗手段，从而为尿路上皮癌患者提供了保留肾脏的治疗选择。 “泌尿上皮癌是指泌尿系统衬里的癌症。虽然大约十种尿路上皮癌中有九种发生在膀胱（下尿道），但一小部分出现在上尿道，肾脏或输尿管衬里。
科学家开发出一款在线风险评估工具 其能帮助计算某个具体地点的COVID-19传播风险
2020年4月26日 讯 /生物谷BIOON/ --公共卫生专家和政府官员一直呼吁人们应该保持“社会距离”，他们要求人们呆在家里，尽量避免相互接触，这无疑会让很多家庭陷入困境，因为他们仍然要去社区购买食物，去药房或其它地方购买补给，人们也并不希望聚集扎堆，而且没有人知道哪些社区最有可能出现接触过病毒的人群。近日，来自凯斯西储大学等机构的科学家们通过研究开发了
亚马逊参与新开发计算工具，助力COVID19研究
目前与冠状病毒感染相关的科学论文有1万多篇，最近几周来，防治COVID-19的研究正在加速，已经有4000多篇新的学术论文发表，涉及潜在的疫苗、疗法等多方面。要想快速推进这方面的研究，依靠人工处理这么大的信息量是低效的。对此，IRB巴塞罗那的结构生物信息学和网络生物学实验室在ICREA研究员Patrick Aloy的带领下，与亚马逊公司联合开发了一种计算工具
Science：让细胞化身为具有蛋白逻辑门的计算机
2020年4月7日讯/生物谷BIOON/---如今，允许计算机发挥功能的相同基础工具在分子水平上正被用于控制生命。这些进展对未来的药物和合成生物学有影响。在一项新的研究中，来自美国华盛顿大学医学院的研究人员构建出作为分子逻辑门发挥作用的人工蛋白或者说定制蛋白。这些称为分子逻辑门的工具就像电子逻辑门那样，可用于对更复杂的系统的行为进行编程。他们指出这些新的人工
精鼎医药宣布收购药理学建模与分析领域领先企业Model Answers
2020年3月2日，精鼎医药，一家领先的、致力于在临床开发到商业化的各个阶段加速创新疗法的研发和上市，以改善人类健康的解决方案提供者，近日宣布收购了一家位于澳大利亚昆士兰州布里斯班市的咨询企业Model Answers。Model Answers是一家为生命科学行业客户提供药代动力学（PK）和药效动力学（PD）建模、模拟和分析服务，以帮助客户提高药物开发成功率的企业。根据已达成的收购协议，Mode