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Nature Methods :“等深度”模型重塑空间生物格局!深度学习与空间转录的完美结合

GASTON通过结合无监督的深度神经网络与可解释性算法,创新性地提出了“等深度”(Isodepth)的概念。

2025-02-01

Nat Commun:通过整合细胞形态和空间转录深度剖析肿瘤生态系统

METI是一种机器学习方法,它通过整合空间基因表达数据和病理学组织学特征,系统性地分析肿瘤生态系统。

2024-09-04

Cell Metab:吕德官等揭示胶质母细胞瘤中调控表观转录的关键代谢途径

该发现揭示了MDH2是维持GSCs代谢和表观转录组网络的关键环节,为开发更为有效的靶向治疗方案铺平了道路。

2024-11-06

干细胞、类器官与表观遗传的交响曲!Nat Neurosci:科学家构建单细胞表观基因图谱,揭示调控细胞命运的关键“开关”

本研究中构建的人类神经类器官发育的单细胞表观基因组图谱,为深入了解人类细胞命运选择提供了宝贵的参考蓝本。

2024-07-22

Mol Cell:HOXDeRNA 通过与基因广泛结合激活癌症转录程序和超级增强子

HOXDeRNA通过rG4结构结合EZH2并招募到PRC2标记的基因组区域,从而去除PRC2对关键胶质瘤转录因子和超级增强子的抑制,最终激活多个癌症驱动基因,驱动星形胶质细胞向胶质瘤转化。

2024-11-07

Nat Cell Biol:赵方庆团队开发基于编程控制的转录实时测序新技术

该研究首次提出了转录组智能测序的概念,依托人工智能纳米孔自适应测序算法,能够实时判断测序分子来源,并可编程选择目标测序分子进行全长测序。

2024-11-03

科研人员开发基于深度学习模型的空间转录精细分辨率细胞注释算法

STASCAN提供了用于整合空间基因表达信息和组织学图像进行精细分辨率细胞注释的工具,在解码细胞空间精细分布和解析特异组织结构方面具有优势。

2024-11-10

Science:新研究揭示表观遗传如何影响哺乳动物记忆形成

小鼠研究结果表明,神经元的表观遗传状态是它在记忆编码中发挥作用的关键。

2024-08-04

Cell:新研究揭示中风改变免疫系统的表观遗传机制

研究发现,身体其他部位出现功能障碍的根源在于骨髓造血细胞的免疫记忆。

2024-08-01

Nature:中外科学家联手揭示结直肠癌的预后基因转录特征

在这篇首次发表的研究论文中,研究者发现了将近100个发生突变的癌症驱动基因。其中,9 个是结直肠癌中的新型基因,24 个是任何癌症的新型基因。

2024-08-15