Emerging Microbes & Infections:我国科学家解析结核杆菌核糖体大亚基与抗生素结合的三维结构1
由结核杆菌引起的结核病是全球重要的慢性疾病。据世界卫生组织发布的《2019年全球结核病报告》数据,全球结核潜伏感染人群约17亿,占全人群的1/4左右,结核病仍是全球前10位死因之一。目前结核杆菌耐药性问题日益严重,了解结核杆菌耐药机制并研发新的治疗结核病药物对实现“终止结核病策略”意义重大。近日,复旦大学和北京大学为主的联合团队在《E
Journal of Advanced Research:揭示油菜杂交种的染色质三维结构特征
近日,华中农业大学涂金星教授和杨庆勇教授团队研究成果以“Comparison of dynamic 3D chromatin architecture uncovers heterosis for leaf size in Brassica napus”为题在Journal of Advanced Research发表。研究首次从染色质三维结构的视角下探究甘
Nature:揭示自由基SAM酶TokK的三维结构,有助于构建更有效的碳青霉烯类抗生素
一类叫做碳青霉烯类抗生素(carbapenems)的强效抗生素可以绕过抗生素耐药性,这要归功于其结构中特定的原子链。如今,在一项新的研究中,来自美国宾夕法尼亚州立大学和约翰霍普金斯大学的研究人员对参与构建这种原子链的一种酶进行了成像,以便更好地了解它是如何形成的---也许可以重现这个过程来改进未来的抗生素。
Nature:揭示人NLRP3十聚体与其抑制剂CRID3结合在一起时的三维结构
在一项新的研究中,来自德国波恩大学和雷根斯堡大学的研究人员阐明了一种称为NLRP3的中枢细胞炎症开关的结构。他们的研究显示了NLRP3抑制剂可以与这种大型蛋白的哪个位点结合。这为开发针对痛风、2型糖尿病等炎症性疾病甚至阿尔茨海默病的新药物开辟了道路。
Cell:在三维空间中模拟活的最小细胞的行为
在一项新的研究中,来自美国伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校和克雷格-文特尔研究所研究所的研究人员报道,他们构建出活的“最小细胞”,其基因组只剩下最基本的要素,与此同时,他们构建出一种反映细胞行为的计算机模型。
Cell:新研究解析出酵母核孔复合体的三维结构
在一项新的研究中,来自美国波士顿大学医学院的研究人员利用快速骤冷和低温电镜与计算方法,构建出酵母核孔复合体(NPC)的综合模型,揭示了其核心支架的相互连接的结构。这项研究为两种构型提供了分子模型:一种是在分离的样本中更容易研究,以提供更详细的径向紧凑形式的概述,另一种是在活的酵母细胞中的扩展形式,尽管这种“原位”形式目前的可视化细节水平较差。
The Innovation:研究解析处于复杂生物环境中的蛋白质机器三维结构
近日,中国科学院生物物理研究所章新政课题组在The Innovation上在线发表题为Determining structures in a native environment using single-particle cryo-electron microscopy images的研究论文。该工作是继2018年开发的分块重构算法
Science Advances:揭示基因组“无用”序列稳定染色质三维结构及细胞稳态机制
人类基因组中的非编码序列在多种生物学过程中发挥着至关重要的作用,如非编码RNA、启动子、增强子和转座子等。作为在基因组中占比约98%的非编码区域,仍有大量是功能未知的,这些曾被认为是基因组中“垃圾”的区域,已被逐渐证实存在重要功能。基因组的三维结构会影响基因的转录调控或其他细胞生命活动,然而,除了研究较多的增强子-启动子成环所形成的三
研究揭示麂属动物染色体融合的分子机制及其基因组三维构象的演化
麂属动物是鲸偶蹄目、反刍亚目、鹿科、麂亚科下的一类哺乳动物,属内各物种间差异巨大的染色体数目而受到生物学家关注,是研究哺乳动物成种机制和染色体演化的优异模型。小麂、黑麂是我国特有的物种,黑麂和贡山麂是我国重点保护野生动物。黑麂和贡山麂都有8条(雌性)和9条(雄性)染色体,它们的核型却不相同,而小麂有46条染色体。自20世纪80年代,我国学者对多种
Science子刊:解析出HIV病毒衣壳的三维结构,有助于开发出靶向HIV衣壳的抗病毒药物
在一项新的研究中,研究人员利用一种基于电子断层成像和子断层扫描图平均化的新技术,解析出HIV衣壳单独存在时和与宿主因子结合在一起时的结构。他们还利用从电子断层成像获得的信息建立了整个HIV衣壳的原子模型,他们认为这可能作为开发靶向HIV衣壳的抗病毒药物的蓝图。