非脱氨酶依赖的嘧啶碱基编辑器TBE获得进展
研究论文报道了一种名为TBE(Thymine base editor)的不依赖脱氨酶的DNA碱基编辑工具。与现存的其他胸腺嘧啶编辑工具相比,TBE表现出更高的编辑效率、更小的细胞毒性和更低的脱靶现象
Nature子刊:魏文胜团队开发不依赖脱氨酶的嘧啶碱基编辑器——TBE
通过优化连接氨基酸、引入具有合成倾向性的DNA聚合酶,还可以进一步提高编辑效率与编辑纯度。全面评估显示,TBE在基因组或转录组水平上都不会导致严重的脱靶编辑,这表明其具有高度的编辑特异性。
Cell:科学家发现新型表观遗传学开关5-甲酰胞嘧啶或在脊椎动物胚胎发育过程中激活基因表达
本文研究结果表明,在Pol III基因表达的合子重编程过程中,5fC或能扮演活化表观遗传学标记的角色。
Nat Chem Biol | 李大力/王立人/曾凡一开发了高精准型的胞嘧啶碱基编辑器
该研究在细胞系和人类疾病动物模型中证明了haA3A-CBEs在纠正各种序列背景下的致病性 SNVs方面的显著效率和精确性。
自由基SAM酶DesII的脱氨机制研究取得进展
实验和计算结果表明DesII通过直接消除催化脱氨反应,这与目前公认的EAL机制形成鲜明对比,并意味着自由基介导的裂解酶活性不必局限于单一的机制。
Nature子刊:何川团队开发超快速精准检测微量DNA与RNA中5-甲基胞嘧啶的新方法
随着UBS-seq的发表,将会进一步促进m5C的生物功能的研究,并和SAC-seq,BID-seq一起引领RNA表观转录组领域步入新的阶段。
Science:揭示嘧啶维持线粒体丙酮酸氧化,支持从头脂肪生成
研究表明,嘧啶是维持这些称为前脂肪细胞的干细胞样脂肪细胞(stem cell-like fat cell)向脂肪细胞分化所必需的。
Blood | 施均/初雅婧/袁卫平发现线粒体tRNA假尿嘧啶化控制红细胞生成
该研究为线粒体tRNA假尿嘧啶化在控制红细胞生成中的关键作用提供了新的见解,并为面临蛋白质翻译相关挑战的贫血患者提供了潜在的治疗策略。
杨辉团队开发两种不依赖脱氨酶的新型碱基编辑器
这两种不依赖脱氨酶(deaminase-free,DAF)的新型碱基编辑器分别在大肠杆菌中实现C-to-A、T-to-A的碱基颠换编辑,在哺乳动物细胞中实现C-to-G、T-to-G的碱基颠换编辑。
Nature子刊:李兵辉团队发现癌症的阿喀琉斯之踵——嘧啶小体
该研究发现了细胞质中的GOT1、CAD及UMPS结合一起,并通过线粒体外膜蛋白VDAC3和锚定在内膜的DHODH形成嘧啶小体(Pyrimidinosome)。AMPK是嘧啶小体调控的重要因子,应激条件