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Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱,CalicoST算法揭示癌症克隆的基因与空间演化

CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异,还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹,绘制出肿瘤演化的“进化地图”。

2024-11-10

深度学习与空间转录学的完美结合

GASTON通过结合无监督的深度神经网络与可解释性算法,创新性地提出了“等深度”(Isodepth)的概念。

2025-02-01

Nature Methods:Chip-Tip技术——突破单细胞蛋白质学研究瓶颈的革命性进展

这项研究不仅推动了单细胞蛋白质组学的技术发展,也为生物医学研究中细胞功能和疾病机制的深入理解奠定了基础。

2025-01-23

Nat Commun:全面分析肾脏微生物或有望帮助开发预防机体肾结石形成的潜在策略

本文研究支持了这样一种假设,即肾脏中或许拥有稳定、能对抗生素产生反应且会影响草酸钙形成的特殊微生物群落,而且肾小球和肾小管中存在着独特、年龄依赖性的微生物特征。

2024-12-31

中山大学科研人员报道代谢学AI分析新方法

DeepMSProfiler利用来自多家医院的859份肺腺癌患者、良性肺结节患者和健康人群的人血清样本进行训练和测试,在独立测试集中成功甄别了不同组别的代谢组学特征,AUC值达0.99。

2024-10-14

Mol Cell:HOXDeRNA 通过与基因广泛结合激活癌症转录程序和超级增强子

HOXDeRNA通过rG4结构结合EZH2并招募到PRC2标记的基因组区域,从而去除PRC2对关键胶质瘤转录因子和超级增强子的抑制,最终激活多个癌症驱动基因,驱动星形胶质细胞向胶质瘤转化。

2024-11-07

Nat Cell Biol:赵方庆团队开发基于编程控制的转录实时测序新技术

该研究首次提出了转录组智能测序的概念,依托人工智能纳米孔自适应测序算法,能够实时判断测序分子来源,并可编程选择目标测序分子进行全长测序。

2024-11-03

Cell Stem Cell:隋鹏飞课题揭示肺基底干细胞线粒体代谢调控新机制

本研究揭示了线粒体丙酮酸代谢在肺基底干细胞命运决定中的核心作用,构建了代谢与表观遗传的调控环路。这一发现为肺部疾病的治疗提供了新的思路。

2024-11-01

Protein & Cell:冷泠课题揭示皮肤类器官移植促进冻伤创面无瘢痕愈合

这项研究强调了皮肤类器官在冻伤期间的细胞命运调控、ECM重塑和皮肤功能恢复方面的重要作用,展现了类器官在促进冻伤损伤愈合和无瘢痕修复的巨大潜力,为冻伤导致的皮肤损伤患者提供了全新的治疗选择。

2024-11-01

Ann Rheum Dis:肠道微生物变化与临床明显的类风湿关节炎发病有关

类风湿性关节炎高危人群的肠道微生物组成与众不同,包括但不限于过量的普雷沃氏菌(Prevotellaceae)。这种微生物特征是一致的,并与传统的风险因素相关。

2024-11-30