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Journal of Genetics and Genomics:单细胞分辨率绘制水稻幼苗叶和根的转录组图谱

  水稻作为重要的粮食作物,为全球一半以上的人口提供主粮;同时,水稻作为单子叶模式植物,其个体发育与细胞分化受到了科研人员持续和广泛的关注。细胞功能的分化常常可以体现为基因表达的差异。新兴的单细胞转录组测序技术使高通量探究细胞的功能分化成为可能。绘制水稻全苗单细胞转录图谱将为单子叶植物的研究工作提供关键的基础资源,为理解植物发育的转录调控

2021-06-24

Protein & Cell:绘制出灵长类海马衰老的单细胞转录组图谱

  海马体作为脑的重要组成部分,在学习和记忆中发挥重要作用。随着年龄增长,海马功能逐渐退化,导致认知功能的减退以及多种人类神经退行性疾病发生。由于海马结构复杂,细胞组成具有高度异质性,传统研究技术难以精确揭示海马衰老过程中不同细胞类型的衰老规律及分子调控网络。此外,由于伦理及样本来源的限制,不同年龄阶段的健康人类海马组织很难获取,这在一定

2021-06-02

ATVB:MicroRNAs或能以一种细胞类型特异性方式来促进机体动脉粥样硬化的发生

2021年6月6日 讯 /生物谷BIOON/ --动脉粥样硬化大多数心血管疾病发病的根本原因,血管壁中与疾病进展相关的主要细胞类型是内皮细胞、平滑肌细胞和巨噬细胞;尽管其在动脉粥样硬化发生过程中所扮演的关键角色如今已经被研究人员广泛描述了,但基因表达改变背后的分子机制,研究人员并不清楚;日前,一篇发表在国际杂志Arteriosclerosis, Thromb

2021-06-06

NAR:新程序或能从700多种不同类型的癌细胞出识别出数千种癌症“弱点”

2021年5月28日 讯 /生物谷BIOON/ --当一个基因的状态暴露了细胞对第二个基因扰动的脆弱性时,比如化学抑制作用,此时就会出现薄弱环节,而该环节恰恰就成为了精准肿瘤学研究的切入点,从而就能帮助开发治疗多种癌症的新型疗法。日前,一篇刊登在国际杂志Nucleic Acids Research上题为“SynLeGG: analysis and visua

2021-05-28

一种新的细胞核分类系统出炉!发现在两种细胞类型之间来回切换的方法

2021年5月29日讯/生物谷BIOON/---150年前,俄国科学家Dmitri Mendeleev创造了化学元素周期表,这是一个根据原子核的特性对原子进行分类的系统。如今,在一项新的研究中,一个研究生命之树的生物学家团队公布了一个新的细胞核分类系统,并发现了一种将一种类型的细胞核转化为另一种类型的细胞核的方法。相关研究结果发表在2021年5月28日的Sc

2021-05-29

Science:揭示人类纹状体发育的单细胞图谱

2021年5月9日讯/生物谷BIOON/---纹状体(striatum)调节着人类社会行为的不同特征,也是在许多神经系统疾病中受到影响的区域。在一项新的研究中,来自意大利、英国和美国的研究人员构建出人类早期胎儿发育过程中该区域的综合单细胞图谱,同时考虑了蛋白编码转录物和长基因间非编码RNA(long intergenic noncoding RNA, lin

2021-05-09

EMBO J:新型细胞图谱或能帮助绘制出人类健康和癌变的乳腺组织

2021年5月16日 讯 /生物谷BIOON/ --乳腺癌包括一系列不同的疾病,其主要特点是异质性,这会影响患者对疗法的反应以及其预后,这种异质性并不能通过组织病理学、肿瘤等级和结节的参与等经典的参数来进行精确定义;为了研究不同状态下乳腺异质性的整体改变,日前,一篇刊登在国际杂志The EMBO Journal上题为“A single‐cell RNA ex

2021-05-16

研究揭示人类衰老细胞空间基因组表观调控核心机制并绘制衰老相关染色质全局景观图谱

   中国科学院上海营养与健康研究所研究员孙宇课题组经合作研究在Nature Aging上,在线发表题为KDM4 Orchestrates Epigenomic Remodeling of Senescent Cells and Potentiates the Senescence-Associated Secretory Ph

2021-05-19

研究人员从单细胞水平揭示造血干细胞扩增的动态图谱

造血干细胞具有自我更新和分化的生物学特征,既可以维持其自身在造血组织中的恒定数量,又能向红系、粒系、巨核系和淋巴系等多种血细胞分化。造血干细胞移植广泛应用于白血病、再生障碍性贫血、骨髓增生异常综合征等临床血液系统恶性肿瘤的治疗,然而,造血干细胞来源不足,限制其广泛应用。因此,如何模拟体内造血干细胞扩增并实现临床转化应用备受关注。斑马鱼造血干/祖细胞(Hema

2021-04-05

Immunity:单细胞染色质可读性图谱分析揭示调节性T细胞参与组织修复的分子机制

众所周知,组织中的调节性T细胞(Treg)对于促进组织稳态和再生具有重要作用。在最近一项研究中,来自德国雷根斯堡大学再生医学中心的Markus Feuerer及其团队揭示了健康组织中具有上述功能的Treg细胞的特征。通过研究鼠和人来源的组织特异性Treg细胞的单细胞染色质可阅读性(accessibility),从而定义了一个保守的,不依赖微生物群的组织修复性

2021-04-01