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Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱,CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化

CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异,还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹,绘制出肿瘤演化的“进化地图”。

2024-11-10

Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱:CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化

CalicoST算法的核心优势在于其能够从SRT数据中精确推断等位基因特异性拷贝数变异(allele-specific CNAs)。

2024-11-23

Mol Cancer:科学家揭示多种类型癌症发生转移背后的特殊遗传驱动因素

本文研究结果表明,通过在体内和体外促使癌细胞中SP1功能丧失,研究人员就能揭示其在驱动癌细胞生存、侵袭性生长和转移性定植中的作用。

2025-01-18

Mol Cell:HOXDeRNA 通过与基因组广泛结合激活癌症转录程序和超级增强子

HOXDeRNA通过rG4结构结合EZH2并招募到PRC2标记的基因组区域,从而去除PRC2对关键胶质瘤转录因子和超级增强子的抑制,最终激活多个癌症驱动基因,驱动星形胶质细胞向胶质瘤转化。

2024-11-07

Nat Genet:靶向作用染色体外DNA或有望开发治疗人类侵袭性癌症的新型疗法

本文研究结果揭示了ecDNAs在肿瘤进展和转移过程中或许能提供一定的竞争优势,同时其也有望作为新型靶点帮助开发治疗人类侵袭性癌症的疗法。

2024-10-20

Nat Genet:通过表观遗传疗法激发转座子新抗原,推进癌症免疫治疗

研究团队以胶质细胞瘤为模型,成功证明了表观遗传疗法激活转座子,从而产生更多转座子新抗原的可能性,为将来表观遗传疗法和免疫疗法的联合治疗提供了理论基础。

2024-09-06

Nature | 粪菌移植:突破癌症免疫疗法瓶颈的新曙光

近年来,癌症治疗领域涌现出了一种令人兴奋的新方法——粪便微生物移植,研究表明,肠道微生物群在免疫疗法的成功与否中起着关键。

2024-07-11

Mol Psych:科学家识别出与人类自闭症发生相关的新型遗传突变

本文研究结果表明,潜在的剪接破坏突变或许在自闭症谱系障碍的遗传学病因学中发挥重要作用,并能允许优先考虑新的自闭症谱系障碍候选基因。

2024-12-19

Nature子刊:我国科学家发现了14个与神经质相关的基因

在分析数据中,有14个基因与神经质(neuroticism)有关,其中12个基因以前从未被发现过。

2024-12-02

Cell:一项大规模研究鉴定700种与抑郁症相关的遗传变异

在这项新的研究中,作者在个体的遗传密码中发现了总共近700种与抑郁症发展有关的变异,其中近一半以前从未与抑郁症相关,涉及308个特定基因。

2025-01-21