The EMBO Journal:拟南芥剪接蛋白参与RNA介导DNA甲基化
2013年3月23日,北京生命科学研究所何新建实验室在《The EMBO Journal》杂志在线发表题为“The splicing machinery promotes RNA-directed DNA methylation and transcriptional silencing in Arabidopsis”的论文。
Anal Chem:李炯等抗甲基化干扰小RNA芯片研究获进展
中科院苏州纳米技术与纳米仿生研究所李炯课题组继2011年在Nucleic Acids Research发表了首次实现常规小分子RNA(无修饰)的高通量非标记芯片方法后,进一步证实该方法也不受小分子RNA的3’末端甲基化影响,可以准确检测上述被修饰的小分子RNA;同时精确定量了商业化芯片中大量使用的Poly(A)聚合酶受3’末端甲基化的影响程度(甲基化小分子RNA的Poly(A)聚合酶反应效率约为常
Anal Chem:李炯等抗甲基化干扰的小分子RNA芯片研究获进展
小分子RNA,包括siRNA(small interfering RNA)、miRNA(microRNA)、piRNA(piwi- interacting RNA)等,多次被美国《科学》杂志评为“十大科技突破”和“十大科学进展”,是当前生命科学研究的前沿热点。大量实验证据表明,这些小分子RNA几乎存在于所有的真核生物细胞中,在调控基因表达、细胞周期、生物体发育等方面起重要作用。
BJC:CACNA2D3基因甲基化可预测乳腺癌扩散风险
在一项新研究中,给一个癌基因加上一种分子“便利贴(post-it note)”能够预测患者乳腺癌扩散的风险。 来自英国伦敦帝国学院(Imperial College London)的英国癌症研究中心研究人员证实CACNA2D3基因上高水平的被称作甲基化的分子修饰与乳腺癌患者体内这种疾病的扩散相关联。2012年7月10日,相关研究成果发表在British Journal of Cancer期刊上。
Biol Reprod:母亲糖尿病能削弱卵母细胞印迹基因的甲基化
科研人员首次证明了没有得到良好控制的母亲糖尿病能对母亲印迹基因Peg3的甲基化产生不良影响,这对后代发育受到损害有贡献。 此前的研究已经表明,糖尿病母亲的后代表现出了更高的畸形和死胎的发生率,即便是把一个单细胞胚胎从糖尿病母亲移植到非糖尿病母亲体内的时候也是如此。
Nature:阐明一种独特的DNA甲基化模型
3月28日,哈佛-麻省理工博德研究所的Alexander Meissner等人在Nature在线发表了一篇名为“A unique regulatory phase of DNA methylation in the early mammalian embryo”的文章,阐明了哺乳动物胚胎早期一种独特的DNA甲基化模型。 DNA甲基化是高度活跃于哺乳动物胚胎形成期。
Genome Res:新方法让甲基化分析不再受限于材料
对于基因组水平的DNA甲基化研究,您有好几种方法可以选择,比如,全基因组亚硫酸氢盐测序。这种方法带来了高分辨率且全面的甲基化模式检测,但它需要大量的起始材料。在构建文库时,通常需要5μg以上的基因组DNA。因此,对于起始材料有限的样本,这种甲基化分析方法不适用。 相比之下,低代表性的亚硫酸氢盐测序需要的起始DNA要少一些,但同时牺牲了全面性。与分析整个基因组不同,这种方法聚焦于基因组的特定区域。
JACS:可利用正交反应法标记甲基转移酶底物
精氨酸甲基转移酶在细胞内参与调解了很多重要的过程,同时,他们的失调也与很多疾病有关,例如癌症。美国斯隆癌症研究中心的王瑞等人最近报道了一种新的正交反应的方法——“Bioorthogonal Profiling of Protein Methylation (BPPM) ”来标记甲基转移酶的底物。
Nature:李海涛等揭示组蛋白变体甲基化识别新机制
清华大学医学院基础医学系、结构生物学中心教授李海涛课题组近日在《自然》杂志在线发表了题为《ZMYND11关联组蛋白变体H3.3赖氨酸36三甲基化(H3.3K36me3)修饰至转录延伸与肿瘤抑制》(ZMYND11 links H3.3K36me3 to