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Advanced Science:韩敬东团队开发转录数据空间重构新算法

该研究建立了一种单细胞/寡细胞转录组数据从头空间重构算法——De Novo Coalescent Embedding(D-CE)。该研究利用细胞-细胞转录相关网络的非线性嵌入方法,从头重构了单细胞转录

2023-06-21

藏野驴肠道菌群宏基因研究获进展

迁地保护是除就地保护之外对濒危野生动物保护的另一种主要方式。动物园作为迁地保护的重要场所,属于典型的人工圈养环境。在该环境中,人工对圈舍消毒灭菌,为动物提供丰富的食物,也会使用抗生素治疗一些疾病。

2023-06-13

Cell:开发新型邻近蛋白质学技术,第一作者秦为已回国加盟清华大学

大城市内的地铁线路错综复杂,每天不同的人会从一个站点通勤到另一个站点,承担着自己的社会责任。细胞内的蛋白质在时间和空间等维度上也是高度动态的,很多蛋白会在不同的细胞器之间甚至是不同的细胞之间进行转运和

2023-07-03

单细胞多组学技术揭示三维基因与基因表达的关系

在高等真核生物中,基因组在细胞核内的三维空间构象对细胞功能至关重要。例如,增强子常常通过三维空间相互作用对远端目的基因的转录活性起调控作用

2023-06-21

Nature:我国科学家分析了中国36个少数民族的基因序列

在一项新的研究中,一个隶属于中国多个研究机构的大型遗传工程师团队完成了为中国不同祖先的人构建泛基因组参考数据的计划的第一阶段。在他们的项目中,作为中国人群泛基因组联盟(Chinese Pangenom

2023-06-23

科研人员揭示基因古病毒复活驱动脑衰老

该研究首次系统地解析了灵长类额叶衰老伴随的组织转录组、单核转录组、蛋白质组及全基因组DNA甲基化层次的多维改变,进而,利用神经病理学检测体系和体外人类神经元衰老模型,提出核纤层(Nuclear lam

2023-06-08

苏州大学第一附属医院研究者们综述了Hippo激酶MST1/2在心血管和代谢性疾病中的作用

心血管疾病(CVD)和代谢紊乱,如糖尿病、肥胖和脂肪肝,是非传染性疾病(NCDs)的主要组成部分,它们在全球范围内引发了巨大的健康和经济负担。

2023-06-09

空间转录数据多模态可视化工具研究取得进展

目前已有工具可以将二维切片的基因表达模式进行可视化,或者进一步堆叠多张切片并形成组织的三维静态视图,但在三维空间中对空间转录组数据的分子特征和空间形态进行交互式探索仍然是一个难点。

2023-06-05

科学家开发出用于肝癌特异性筛查的全基因cfDNA片段化特征检测方法

肝癌的发病率和死亡率在癌症中位居前列,全世界每年新增病例超过90万,死亡病例超80万。在所有肝癌病例中,肝细胞癌 (HCC)占比约90%,对肝细胞癌高危人群进行有效、高灵敏度的筛查显得尤为重要。目前对

2023-06-25

张锋团队在动物身上发现了新的类似CRISPR/Cas的系统,可以编辑人类基因

在一项新的研究中,美国布罗德研究所以及麻省理工学院麦戈文大脑研究所的张锋(Feng Zhang)教授领导的一个研究团队发现了包括真菌、植物和动物在内的真核生物中第一个可编程的RNA引导系统。该团队描述

2023-07-03