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Nature子刊:通过机器学习模型识别复杂疾病的重要生物标记物

2021年5月27日讯/随着高通量技术的发展,通过世界各地研究人员的共同努力,形成了大型公共数据库,如癌症基因组图谱(TCGA)。这对阐明疾病表型的分子机制具有重大意义。然而,由于癌症等复杂疾病的病理以及其在遗传、基因组和蛋白质组水平上复杂的分子机制,研究复杂的人类疾病仍具有挑战性。目前,已有很多基于机器学习的方法开发出来,包括非线性核支持向量机(SVMs)

2021-05-31

单原子纳米酶理性设计研究获进展

  Nature Catalysis发表了题为Matching the kinetics of native enzymes with a single-atom iron nanozyme的研究文章。该研究设计了一种以FeN3P为中心的单原子纳米酶(FeN3P-SAzyme),通过磷和氮的精确配位来控制单原子铁活性中心的电子结构,表现出

2021-05-19

Nat Med:开发出新型机器学习技术 或有望改善胎儿先天性心脏病等出生缺陷的筛查

2021年5月30日 讯 /生物谷BIOON/ --先天性心脏病(CHD,Congenital heart disease)是一种最常见的出生缺陷,胎儿超声筛查能提供5个心脏视图,而这些视图能帮助检测90%的复杂先天性心脏病,但在医学实践中,这种筛查的敏感性会低至30%。日前,一篇发表在国际杂志Nature Medicine上题为“An ensemble o

2021-05-30

iScience:科学家有望设计出抑制肿瘤生长的新型抗体疗法

2021年5月11日 讯 /生物谷BIOON/ --CD146是一种粘附分子,其在血管生成、癌症转移和机体免疫反应过程中扮演着非常关键的角色;CD146经常会以一种单体或二聚体的形式存在于细胞表面;AA98则是一种能与CD146分子结合的单克隆抗体,其能“废除”CD146介导的信号通路的激活作用并能展示出对肿瘤生长的抑制效应,然而,目前研究人员并不清楚AA9

2021-05-10

研究建立植物高效引导编辑设计策略

 实现重要农作物精准基因组编辑对加快农作物遗传改良进程具有重要意义。引导编辑技术(Prime Editing)能够在基因组的靶位点处实现精准的片段插入、删除及碱基的任意替换。引导编辑系统由两部分构成:一部分是nCas9(H840A)与工程化改造的逆转录酶(Reverse Transcriptase, RT)融合构成的PE效应蛋白;另一部分是包含PB

2021-04-02

Nature子刊:试验表明AI引导有助于在常规实践中早期发现心脏疾病

某些类型的心脏疾病可能很难发现,例如无症状的低射血分数,特别是在治疗最有效的早期阶段。心电图AI引导下的低射血分数筛查(EAGLE)试验旨在确定利用心电图数据开发的人工智能(AI)筛查工具是否能改善常规实践中这种病症的诊断。根据发表在《自然—医学》上的研究结果,答案是肯定的。收缩期低射血分数定义为心脏无法在每次跳动时足够强烈地收缩,以从其腔室中抽出至少50%

2021-05-09

光催化CO2还原酶的理性设计研究获进展

近期,ACS Catalysis发表了中国科学院生物物理研究所研究员王江云课题组、中国科学技术大学教授田长麟课题组题为Rational design of a miniature photocatalytic CO2 reducing enzyme的研究论文。该研究设计出一种33 KDa的光催化CO2还原酶(mPCE),该酶含有BpC发色团的光敏蛋白域和含两

2021-05-05

引导编辑研究取得进展

  新型基因编辑系统引导编辑(prime editing,PE)可以在基因组的靶向位点实现任意类型的碱基替换、小片段的精准插入与删除,这种灵活的、可设计的遗传修饰能力使其在基础研究、人类疾病治疗和农作物育种中潜力巨大。该系统由nCas9(H840A)融合逆转录酶(reverse transcriptase,RT)和pegRNA(prime

2021-04-18

Nature 子刊:多组学数据与机器学习识别新的癌症基因

癌症基因的鉴定在精准肿瘤学和癌症治疗学的发展中起着至关重要的作用。癌症的进展被认为是由驱动基因突变的积累引起的,这些突变赋予细胞选择性的生长优势。在过去的几年里,人们致力于从遗传大数据中找出癌症基因,预测癌症基因的最初方法是寻找显着突变的基因,然而,目前已知的癌症基因(KCG)目录的完整性仍存在争议。尽管成千上万的癌症基因组序列有助于癌症基因的鉴定,但仍存在

2021-04-30

“植物保护与分子设计育种科技创新论坛”成功召开

 由植物细胞与染色体工程国家重点实验室、植物病虫害生物学国家重点实验室、闽台作物有害生物生态防控国家重点实验室联合举办,福建农林大学植物免疫研究中心承办的“植物保护与分子设计育种科技创新论坛”,在福州成功召开。中国科学院遗传与发育生物学研究所所长杨维才研究员、植物细胞与染色体工程国家重点实验室主任傅向东研究员,中国农科院植保所所长助理、植物病虫害生

2021-04-22