Science:利用人工智能工具AlphaMissense对错义变异进行分类
基因组测序揭示了人类群体中广泛的基因变异。错义变异是改变蛋白氨基酸序列的基因变异。致病性错义变异(pathogenic missense variant)会破坏蛋白功能,降低生物的适应能力,而良性错义
Nature:利用人工智能工具发现新的蛋白家族和褶皱
在一项新的研究中,来自瑞士生物信息学研究所和巴塞尔大学的研究人员发现了一个未表征蛋白的宝库。在最近的深度学习革命中,他们发现了数百个新的蛋白家族,甚至还发现了一种新的预测蛋白褶皱。相关研究结果于202
Nature重磅:张锋团队首次在真核生物中发现CRISPR样系统,为基因编辑再添新工具
在这项最新研究中,研究团队从真菌、藻类、变形虫以及北圆蛤(一种蛤蜊)中分离 Fanzor 蛋白,并进行 RNA 引导系统得研究。对 Fanzor 蛋白的生化表征表明,Fanzor 是一类 DNA 切割
Front Immunol:新工具可预测基于T细胞的免疫疗法是否会错误地攻击健康细胞
在一项新的研究中,来自美国休斯顿大学的研究人员努力让T细胞免疫疗法更加安全,他们开发了一种名为CrossDome的工具,该工具结合遗传信息和生化信息来预测T细胞免疫疗法是否可能错误地攻击健康细胞。相关
Nature子刊:光遗传学工具LiSmore助力精准细胞免疫疗法
综上,光遗传学工具LiSmore的应用可实现蓝光作用下时空特异性地激活STING信号通路,与STING小分子激动剂相比,LiSmore的应用避免了系统性给药带来的STING通路过度激活、泛细胞激活带来
Nature子刊:百图生科宋乐团队开发新型蛋白质结构预测工具,不依赖多序列对比,效率更高
与基于MSA的的主流蛋白质结构预测工具AlphaFold2和RoseTTAFold方法相比,HelixFold-Single在预测效率上具有很大优势,耗时要少得多,可以应用于需要大量预测的蛋白质相关任
华人一作:谷歌DeepMind再推出革命性AI工具,预测和表征人类致病基因突变
当然,AlphaMissense距离实际的临床应用还有很大的一段距离要走,AI预测目前在诊断遗传疾病方面的作用还很小,这些工具应该只提供支持性证据将遗传变异与疾病联系起来。
JAMA双重磅:基于眼动追踪的自闭症诊断工具与金标准表现一致,已获美国FDA授权用于临床诊断
自闭症谱系障碍(ASD)在全世界的平均发病率已经达到1%,患者的疾病严重程度和需求各不相同,部分可以独立生活,部分则因严重残疾需要终身护理和支持。尽管很多患者在儿童时期早期即表现出一些症状,但诊断往往
Cell:开发出一种类似乐高积木的基因编辑工具---ModPoKI,有望改善CAR-T细胞疗法
近年来,科学家们利用基因修饰技术将免疫细胞重编程为可以攻击癌症的疗法。但这类免疫疗法并非对所有患者或所有癌症类型都有效,而且筛选每一种可能改善这些经过重编程的免疫细胞的基因变化组合是一项艰巨而缓慢的任
研究人员开发出定量蛋白质组学数据的下游分析与可视化工具
基于超高分辨率液质联用质谱的定量蛋白质组学已成为重要的生命科学研究手段。与其他组学方法一样,恰当的数据分析流程是蛋白质组学研究的关键。基于质谱的蛋白质组数据具有方法仪器多样、搜库定量软件繁多的特点,导