Nature:提出新的增强子选择启动子的模型
增强子与启动子是高等动物尤其是人类中最重要的两类基因表达调控元件。它们之间的有效互作可保证基因的准确转录,从而保证细胞状态和正常发育。它们之间的错误联系也同样可以导致疾病相关的基因表达异常。因此,了解增强子选择启动子的机制可帮助更好地认识健康与疾病。美国德克萨斯大学休斯敦健康科学中心麦戈文医学院的李文博研究组和加州大学圣地亚哥分校Michael Rosenf
Gastroenterology:研究通过单细胞基因组测序揭示肝细胞癌的双相拷贝数演化模型
胃肠病学领域学术期刊Gastroenterology以长文形式在线发表了北京大学第一医院肿瘤转化研究中心张宁课题组的研究成果。在题为“Single cell DNA sequencing reveals punctuated and gradual clonal evolution in hepatocellular carcinoma”的研究论文中,研究人
Science Advances:科学家利用3D打印技术制作出完整的胶质母细胞瘤模型
目前肿瘤研究常用的模型是2D培养皿中生长的肿瘤细胞,但这种模型缺乏肿瘤与间质的相互作用,并不能很好地模拟肿瘤增长的复杂生物学环境。这也是许多抗肿瘤药物在实验室阶段显示出良好的效果、但在临床试验中实际效果不佳的主要原因。为此,以色列的科学家团队利用3D打印技术制作出可以模拟神经母细胞瘤多种生物学特征的模型,该研究发表在《Science Advances》杂志,
Science:利用新型机器学习技术准确预测蛋白和RNA的三维结构
美国斯坦福大学博士生Stephan Eismann和Raphael Townshend在该大学计算机科学副教授Ron Dror的指导下,利用巧妙的新型机器学习技术,开发出一种通过计算预测准确结构来克服这一问题的人工智能算法。最值得注意的是,即使只从少数已知结构中学习,他们的方法仍然成功,这使得它适用于那些结构最难通过实验确定的分子类型。
Nature Communications:研究基于深度学习算法优化序列特异性的C-to-G单碱基编辑器
Nature Communications发表了题为Optimization of C-to-G base editors with sequence context preference predictable by machine learning methods的研究论文,该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心、上海脑科学与类脑研究中心研究员孙
Cell Rep:小分子蛋白MOTS-c或能保护1型糖尿病模型的胰岛细胞 并降低自身免疫性糖尿病的发病风险
2021年8月23日 讯 /生物谷BIOON/ --线粒体是细胞中一种主要的代谢细胞器,如今其作为免疫调节器的角色逐渐被研究人员所阐明;然而目前研究人员并不清楚是否线粒体所编码的多肽类能调节T细胞从而诱导细胞表型和功能的改变。近日,一篇发表在国际杂志Cell Reports上题为“Mitochondrial-encoded MOTS-c prevents p
Nat commun:用于肌萎缩性侧索硬化症研究的人类感觉运动器官模型构建
神经肌肉连接(NMJ)是神经肌肉神经系统的核心突触,与运动神经元疾病、神经病、连接障碍和肌病的诊断和治疗具有相关性。
Journal for ImmunoTherapy of Cancer:重组耻垢分枝杆菌提供人巨噬细胞迁移抑制因子(MIF)和IL-7的融合蛋白,通过在荷瘤小鼠模型中诱导针对
rSmeg-hMIF-hIL-7降低了MIF的致瘤作用,增强了其对肿瘤的治疗效果。
Nature:基于机器学习的工具BoostDM可识别每种肿瘤类型的癌症驱动突变,有助开发个性化癌症治疗
2021年8月4日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自西班牙巴塞罗那生物医学研究所的研究人员开发出一种计算工具,它可以识别每种肿瘤类型的癌症驱动突变。这一发现有助于加速癌症研究,并提供工具帮助肿瘤学家为每名患者选择最佳治疗方法。相关研究结果于2021年7月28日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“In silico saturation
Neuroscience Bulletin:研究人员构建具备帕金森核心表型的基因编辑成年猕猴模型
帕金森病(Parkinson’s disease, PD)主要影响65岁以上的老年人,发病率约2-3%。PD因较高的发病率、早期诊断困难及治疗效果不佳等问题影响国民健康,给患者家庭与社会保障带来负担。目前,PD的病因与发病机制尚不明确,但表型清楚。PD的核心症状为运动迟缓,伴随静止性震颤、肌强直与姿势异常等临床表现;其典型病理特征包括中脑黑质致密区多巴胺能神