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研究开发N-磷酸化蛋白质组深度覆盖分析新方法

近日,中国科学院大连化学物理研究所生物分子高效分离与表征研究组研究员张丽华和中科院院士张玉奎团队,发展出N-磷酸化肽段高选择性富集新方法,并结合肽段的高效分离和高灵敏度鉴定,实现了N-磷酸化蛋白质组的深度覆盖分析。与研究相对深入的发生在丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸侧链氨基上的蛋白质O-磷酸化修饰相比,发生在蛋白质组氨酸、精氨酸和赖氨酸上的N-磷酸化修饰,由于P-N

2020-12-20

开发出CiBER-seq新技术,可同时分析细胞中的多达100个基因

2020年12月16日讯/生物谷BIOON/---CRISPR-Cas9可以很容易地敲除或调整单个基因,以确定其对有机体或细胞,甚至另一个基因的影响。但是,如果你能一次进行几千个实验,利用CRISPR逐个对基因组中的每一个基因进行调整,并快速看到每一个基因的影响呢,那会怎么样呢?在一项新的研究中,来自美国加州大学伯克利分校的研究人员开发出一种简单的方法来做到

2020-12-16

Genomics:鲨鱼基因组学分析发现关键抑癌基因

很多报道称鲨鱼中癌症的发病率很低,但没有足够的数据来明确地确认。然而,发表在《Genomics》杂志上的一项研究提供了强有力的证据,证明了短鳍鲨(Isurus oxyrinchus)的基因组中具有抗肿瘤活性。

2020-12-02

Nat Commun:科学家首次实现对细胞膜进行超高分辨率成像及分析

2020年12月8日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一篇发表在国际杂志Nature Communications上的研究报告中,来自维尔茨堡大学等机构的科学家们通过研究实现了在超分辨率下对细胞膜进行观察;研究者表示,扩张显微镜(Exm,Expansion microscopy)能以远低于200nm的空间分辨率对细胞及其组分进行成像,为此,所研究样品的蛋

2020-12-08

限额|12月广州生信分析培训(含2020肿瘤标志物学术大会门票)

12月9-10日中国抗癌协会肿瘤标志专委会肿瘤测序及大数据分析专家委员会,组织生物信息学教学和科研一线的教师和博士团队于广州冠盛皇室堡酒店开展线下生信分析培训——肿瘤标志物挖掘技术与应用必备技能培训,紧贴当今领域前沿,帮助生物医学研究同行拓展新的科研思路和开辟新的科研模式!本届培训班由生物谷倾情协办,作为2020年中国肿瘤标志物学术大会(CCTB)亮点活动之

2020-11-17

纳米孔全长cDNA测序和直接DNA甲基化分析解决大麻基因组拷贝数的争论

 大麻(Cannabis sativa)通常分为大麻(Marijuana)和工业大麻(Hemp),通常依据植物产生THC(四氢大麻酚)的含量来区分:大麻的THC含量通常较高(> 10%),工业大麻通常较低(<0.3%),但他们都可以产生高水平的CBD(大麻二酚),工业大麻可用作纤维和燃料且市场增长很快。2015年,索尔克生物研究所(Sa

2020-11-19

研究开发出基于深度学习的单细胞转录组分析模型

  单细胞转录组作为单个细胞的特征,可更加精确地定义细胞的类型。常规的基于单细胞转录组的分类方法首先是进行无监督的聚类,然后根据每个集群(Cluster)特异表达的细胞标记基因来对集群进行标注。虽然基于无监督的分类方法更容易发现新细胞类型,但是人工标注的过程费时费力。目前已有的基于监督学习的自动分类方法,大部分无法兼顾到方法的可解释性以及

2020-11-12

新冠疫苗首个三期临床中期分析效果突出

 今天BioNTech /辉瑞公布了其新冠病毒感染mRNA疫苗BNT162b2三期临床的一个中期分析结果。这个三期临床招募43,538 位志愿者、分别使用两针该疫苗和安慰剂,原计划总两组共32人感染时进行第一个中期分析、但后来扩大到62人, 最后分析需要等164人感染。今天这个分析是根据第二针疫苗7天后(第一针28天后)94位感染患者的数据,结果显

2020-11-10

香港大学Kelvin Kai-Wang To 博士团队:纳米孔全基因组测序分析发现全球首例COVID-19康复患者二次感染

 8月,香港大学Kelvin Kai-Wang To 博士团队利用纳米孔手持便携式测序仪MinION进行全基因组测序,结合ARTIC和Medaka工作流程分析,发现全球首例COVID-19康复者二次感染病例,基因组学分析显示两次感染病毒不同。对两次感染的病毒基因组学进行分析发现首次感染的病毒基因组属于GISAID V分支、Nextstain19A分

2020-11-17

香港理工大学副教授Gilman Kit Hang Siu 研究团队:纳米孔测序分析香港第三波疫情或由外地输入

 7月初起,中国香港特区出现第三波新冠病毒大规模传播。7月底,香港文汇报、轻新闻、icable TV、now TV等多家媒体报道:香港理工大学副教授Gilman Kit Hang Siu(萧杰恒)研究团队基于纳米孔测序技术,对26名病人病毒样本进行SARS-CoV-2溯源研究,发现确诊感染者体内的病毒株属同类(“G型病毒株”的变种“GR型病毒株”)

2020-11-17