科学家构建RNA结合蛋白的剪接调控作用预测模型
基因组研究结果显示,人体内超过90%的基因存在选择性剪接(alternative splicing)。该过程在不同组织以及不同生理阶段受到严格的调控,其失调会导致多种疾病的发生。选择性剪接的体内调控主要由前体mRNA中的顺式元件(cis-elements) 招募反式剪接作用因子(trans-acting splicing factors)来实现。通常情况下,反式剪接作用因子存在一个模块
研究发现RNA剪接基因编辑的新方法
10月5日,国际学术期刊《分子细胞》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院(营养与健康研究院)常兴研究组题为Genetic modulation of RNA splicing with a CRISPR-guided cytidine deaminase 的最新研究成果。证明可以利用TAM (Targeted-AID induced mutagenesis)基因编辑,靶向
pre-mRNA中存在的修饰及其对剪接影响
2018年10月7日 讯 /生物谷BIOON/--日前,作为“诺贝尔奖风向标”的拉斯克奖——拉斯克·科什兰医学特殊成就奖颁给了Joan Argetsinger Steitz教授(致敬Joan Steitz!2018年拉斯克特别成就奖获得者),以表彰她在生物医学领域,尤其是RNA生物学领域中所发挥的领军作用。RNA在生命体内发挥着重要作用。早在1958年,Francis Crick提出的“中心法则”
Mol Cell:基因的剪接作用如何影响机体的患病风险
2018年9月4日 讯 /生物谷BIOON/ --没人知道一天中有多少次,甚至在一个小时内,我们体内的数万亿个细胞需要制造多少蛋白质,但我们知道,细胞会以大规模的方式在不断制造蛋白质,一旦该过程发生的话,细胞核中就会发生一种称之为RNA剪接(RNA splicing)的编辑过程,其能够确保RNA指令被传送至与机体基因蓝图精确对应的细胞工厂中。图片来源:Diagram courtesy of Kha
中国学者研发可变色"心脏芯片" 通过颜色变化监测心脏搏动
中国科研团队受变色龙“变色”机制启发,用心肌细胞和水凝胶开发出一种新材料,可用于构建可变色的“心脏芯片”,通过芯片颜色变化来监测心脏搏动。最近发表于美国《科学·机器人学》杂志上的一篇论文显示,研究人员将大鼠心肌细胞培养在反蛋白石结构的水凝胶薄膜上,反蛋白石结构水凝胶具有有序的纳米结构,可像蛋白石一样反射特定的波长,表现为鲜艳的结构色。中国东南大学生物科学与医学工程学院赵远锦
Neuron:科学家揭示控制神经元细胞成熟的特殊发育剪接程序
2018年2月7日 讯 /生物谷BIOON/ --大脑中的神经元细胞能够通过传递电信号或“引燃”动作电位来实现彼此之间的交流,而这一交流过程需要通过轴突和树突来实现,而传递电信号的这种能力常常是在神经元发育和成熟过程中来获得的,然而指导这一复杂过程的分子机制目前研究人员并不清楚。为了揭示控制神经元发育的复杂机制,来自哥伦比亚大学医学中心的研究人员对一种名为选择性剪接的分子调节机制进行了相关研究,相
Cell Reports:研究发现DBF4B剪接在肿瘤细胞中的调控作用
1983年,Evans等人在实验中发现在海胆卵细胞中存在两种特殊蛋白质,它们的含量随着细胞周期的进程而变化,一般在细胞间期内积累,在细胞分裂期消失,在下一个细胞分裂周期中又重复。因而他们将这两种蛋白命名为细胞周期蛋白(cyclin)。随后,这些周期蛋白很快被分离和克隆出来,并被证明广泛存在于从酵母到人类的各种真核生物中。细胞周期蛋白(cyclin)是参与细胞周期调控的蛋白,并且其浓度在细胞周期中是
施一公院士说的可变剪接咋分析?烈冰自主研发的可变剪接算法 ASD和CASH来帮你!
最近,剪接体可是着实火了一把。这其中不得不提的就是施一公院士。施一公何许人也,相信也不用多做介绍。中国科学院院士、清华大学副校长、生命科学院院长、杰出的结构生物学家,更是一位有情怀有理想有态度的大师级学者。2017年9月9日,施一公教授荣获“未来科学大奖-生命科学奖”,获奖评语中写道,该奖项旨在“表彰他在解析真核信使RNA剪接体这一关键复合物的结构,揭示活性部位及分子层面机理的重大贡献”,可谓实至
Cell报道酿酒酵母剪接体处于完成RNA剪接后构象的高分辨率电镜结构
2017年11月17日,清华大学生命学院、结构生物学高精尖创新中心施一公教授研究组就剪接体的结构与机理研究于《细胞》(Cell)杂志再次发表最新成果。这篇题为《酿酒酵母“催化后剪接体”的结构》(Structure of the Post-catalytic Spliceosome from Saccharomyces cerevisiae)的论文报道了酿酒酵母剪接体呈现RNA剪接反应完成后状态(定
Science:解析出酵母P状态剪接体的高分辨率结构
图片来自UCLA。2017年11月18日/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自美国加州大学洛杉矶分校(UCLA)和科罗拉多大学丹佛分校的研究人员解析出一种大型的被称作剪接体(spliceosome)的细胞机器的高分辨率结构。在我们理解之前并不清楚的RNA剪接过程中,这一发现填补了最后一个重大的缺口。这些研究人员解析出的酵母P状态剪接体(spliceosome P complex)的分辨率