科研人员开发基于分子网络特征整合单细胞数据的新方法
随着单细胞测序技术的快速发展，多个全球性的、大规模的细胞图谱项目相继启动，例如人类细胞图谱计划等。然而，把来自于不同组织、不同发育阶段或者只有很少重叠细胞类型的单细胞转录组数据集进行准确有效的整合仍然具有非常大的挑战性。因为当前整合单细胞数据的方法需要校正批次效应从而达到整合分析的目的，而上述所涉及的数据集的批次信息不清晰，利用这些方
Nature Communications：揭示多能干细胞维持基因组稳态新机制
多能干细胞是个体发育的基础，也是再生医学的重要种子细胞之一。由于发育地位特殊，多能干细胞基因组具高度稳态（如小鼠胚胎干细胞的基因组变异率仅为胚胎成纤维细胞的1/100）。尽管多能干细胞较分化细胞具更强的基因组稳态维持能力，大量扩增培养、持续的DNA复制及特殊的细胞周期往往导致基因组变异，破坏其分化潜能，并产生致瘤风险，成为
EMBO ：利用单细胞测序解析人胚胎脊髓发育过程
脊髓是外周系统与大脑间信号传递的桥梁。脊髓背角介导着外周感受信号，而腹侧对于运动功能的执行至关重要，同时也是低级反射的中枢。作为一种高度有序的中枢组织，脊髓由多种不同的细胞类型有序发育形成。虽然脊髓的发育在啮齿类动物中已进行了一系列的研究，但对人类脊髓发育过程了解较少。中国科学院遗传与发育生物学研究所戴建武再生医学团队长期从事脊髓损伤
Nat Immunol：“垃圾DNA”—逆转录转座子或是一把双刃剑！既能诱导肿瘤发生还能引发癌细胞死亡！
来自美国罗彻斯特大学等机构的科学家们通过研究揭示了诱发肿瘤的自私遗传元件引发癌细胞死亡的分子机制。
Gastroenterology:研究通过单细胞基因组测序揭示肝细胞癌的双相拷贝数演化模型
胃肠病学领域学术期刊Gastroenterology以长文形式在线发表了北京大学第一医院肿瘤转化研究中心张宁课题组的研究成果。在题为“Single cell DNA sequencing reveals punctuated and gradual clonal evolution in hepatocellular carcinoma”的研究论文中，研究人
HIF-1招募NANOG作为低氧乳腺癌干细胞中TERT基因转录的共激活因子
乳腺癌干细胞在肿瘤形成、耐药、复发和转移中发挥着重要作用。NANOG是干细胞自我更新所必需的一种蛋白质，但其实现这一功能的机制尚不清楚。
Nature Communications：绘制川崎病单细胞免疫图谱
中国科学院上海营养与健康研究所、上海市儿童医院、上海国际人类表型组研究院等合作，完成了川崎病外周血单细胞免疫图谱的绘制工作。相关研究成果以Single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells from acute Kawasaki disease patients为题，在线发表在Na
睡莲属植物细胞器RNA转录后加工研究取得进展
植物细胞中有三个相对独立的基因组，即核基因组、叶绿体基因组和线粒体基因组，后两者常被称为细胞器基因组。RNA转录后加工，内含子剪接、RNA编辑、5’和3’端成熟等在植物细胞器基因组的基因表达和调控中很常见。植物细胞器RNA编辑已有报道，包括无油樟（Amborella trichopoda）及鹅掌楸（Liriodendron tulipifera）的细胞器RN