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Advanced Science:韩敬东团队开发转录数据空间重构新算法

该研究建立了一种单细胞/寡细胞转录组数据从头空间重构算法——De Novo Coalescent Embedding(D-CE)。该研究利用细胞-细胞转录相关网络的非线性嵌入方法,从头重构了单细胞转录

2023-06-21

空间转录数据多模态可视化工具研究取得进展

目前已有工具可以将二维切片的基因表达模式进行可视化,或者进一步堆叠多张切片并形成组织的三维静态视图,但在三维空间中对空间转录组数据的分子特征和空间形态进行交互式探索仍然是一个难点。

2023-06-05

迄今最大规模研究破解持久性CAR-T细胞转录特征

Ghorashian团队认为,他们这个研究最重要的发现是发现了持久性CAR-T细胞的独特转录特征。而且这个特征在不同人群、不同CAR-T疗法中也存在。因此这暗示着,这种独特的转录特征有可能代表了持久性

2023-07-14

单细胞转录测序,揭示动物发育过程“古老”和“年轻”基因的表达模式

这一研究揭示了不同细胞类型在转录组年龄上的显著差异,有助于对不同细胞的进化起源进行估计,为理解驱动物种进化的遗传机制提供了新的视角

2023-05-17

单细胞多组学技术揭示三维基因与基因表达的关系

在高等真核生物中,基因组在细胞核内的三维空间构象对细胞功能至关重要。例如,增强子常常通过三维空间相互作用对远端目的基因的转录活性起调控作用

2023-06-21

Nature子刊:李婧翌团队开发用于单细胞多组学和空间学的数据模拟和统计推断的多功能模拟器scDesign3

总的来说,scDesign3是一个多功能套件,用于基准测试计算方法和解释单细胞和空间组学数据。

2023-05-15

异体细胞治疗 – 利用单细胞多功能蛋白技术监测细胞质量和预测疗效

自2017年FDA首次批准以来,被称为CAR-T疗法的嵌合抗原受体(CAR)T细胞已经改变了被诊断为血液恶性肿瘤患者的治疗格局。细胞治疗产品分为自体细胞和异体细胞两类。

2023-05-05

《自然·衰老》:全海马单细胞转录学研究,全面揭示APOE4促进阿尔茨海默病发生机制

阿尔茨海默病(AD)是一种多见于老年人的神经系统退行性疾病。正如影视作品中所描述的这样,随着疾病的进展,患者逐渐忘记周围的人,忘记自己引以为傲的过去,失去丰沛的感情,最终丧失生活能力。

2023-03-13

单细胞转录研究进展与应用

2月16日14:00

2023-02-03

Cell:在单细胞分辨率下揭示小鼠大脑衰老的分子和空间特征

在一项新的研究中,来自美国哈佛大学的研究人员的新发现为我们提供了炎症与随着年龄增长而经历的认知障碍之间的关系的新见解,并表明这可能是一种细胞链式反应的结果。相关研究结果近期发表在Cell期刊上。

2023-02-20