科研人员开发出分子序列组分动态图谱数据库CompoDynamics
生物体的核酸与蛋白质分子的序列组分及相关特征（如GC/AG含量、密码子使用偏好、蛋白质物理化学性质等）对于研究基因功能和物种演化具有重要意义，是理解不同物种、不同基因家族以及不同功能基因之间差异的数据基础。近日，由中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心开发的分子序列组分动态图谱数据库CompoDynamics正式上线，旨在对序列
Molecular Cancer: 颅咽管瘤中CTNNB1新突变的全基因组序列分析
颅咽管瘤(CP)是一种罕见的组织学良性肿瘤，但因其与中枢神经系统的重要结构密切相关，临床上极具挑战性。CP可分为两大亚型：造釉细胞型CP(ACP)和乳头型CP(PCP)。
Nat Biotechnol：新型先导编辑系统可在人细胞中插入完整的序列
先导编辑（prime editing）首次开发于2019年，是一种在人类细胞中进行广泛的基因编辑的精确方法，包括小型替换、插入和缺失。在一项新的研究中，来自美国布罗德研究所的研究人员开发了一种新版本的先导编辑：双先导编辑（twin prime editing, twinPE），它可以整入或置換出基因大小的DNA序列。
我国科学家开发高效基因组序列分析工具
人类的疾病易感性和生理特征等常见性状的差异，往往由DNA序列变化造成，这些DNA片段缺失、增加、异位等变化被统称为遗传变异。全基因组关联研究（Genome-Wide Association Study，GWAS）是通过比对大量人群的遗传信息，利用统计学检测遗传变异和性状之间关联性的方法。西湖大学的研究团队开发了可用于百万级生物样本库的全基因组关联
Science Advances：揭示基因组“无用”序列稳定染色质三维结构及细胞稳态机制
人类基因组中的非编码序列在多种生物学过程中发挥着至关重要的作用，如非编码RNA、启动子、增强子和转座子等。作为在基因组中占比约98%的非编码区域，仍有大量是功能未知的，这些曾被认为是基因组中“垃圾”的区域，已被逐渐证实存在重要功能。基因组的三维结构会影响基因的转录调控或其他细胞生命活动，然而，除了研究较多的增强子-启动子成环所形成的三
Nature Communications：研究基于深度学习算法优化序列特异性的C-to-G单碱基编辑器
Nature Communications发表了题为Optimization of C-to-G base editors with sequence context preference predictable by machine learning methods的研究论文，该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心、上海脑科学与类脑研究中心研究员孙
Cell：探究DNA结合蛋白如何结合核小体上的DNA序列
2021年7月6日讯/生物谷BIOON/---在细胞核中，DNA以染色质的形式存在，紧紧包裹在组蛋白周围，因此大部分难以接近，那么蛋白质如何与DNA结合？最近，一些研究开始揭示DNA结合蛋白用来解决这个问题的各种策略。在一篇发表在Cell期刊上的前沿综述文章中，Alicia Michael和Nicolas Thomä研究了这些发现，并强调了旨在帮助
Science：揭示MeCP2蛋白结合羟甲基化的CA重复序列，保护CA重复序列免受核小体入侵
2021年6月30日讯/生物谷BIOON/---雷特综合征（Rett syndrome）是一种严重的神经发育障碍，主要是由基因MeCP2（methyl-CpG-binding protein 2, 甲基CpG结合蛋白2）突变引起。最初，MeCP2被认为是一种重要的脑蛋白，它通过它的甲基结合结构域（MBD）与甲基化的CpG（mCG）结合，起到转录抑制的作用。然
RNA序列竟可写入DNA，传统“中心法则”遭受挑战
说到“中心法则”（Central Dogma），想必大家定不会陌生，这一现代生命科学的基本定律由英国著名生物学家 Francis Crick 于 1958 年正式提出。它指明了遗传信息的标准流程，即“DNA→DNA（DNA 的自我复制，replication），DNA→RNA（转录，transcription），RNA→蛋白质（翻译，translation）
Cell Death & Differentiation：BCL-XL是通过结直肠癌腺瘤到癌序列进展的关键
避免凋亡是癌症的一个标志，这通常是通过上调抗凋亡BCL-2家族蛋白介导的。在结直肠癌(CRC)中，先前的工作强调了疾病阶段决定的不同的抗凋亡蛋白依赖。肠道干细胞(ISCs)在转化过程中需要BCL-2来实现腺瘤的生长和存活，而ISCs特异性的MCL1缺失会导致肠道稳态紊乱，最终导致肿瘤发生。然而，结肠癌干细胞(CSCs)不再需要BCL-2，而主要依赖BCL-X