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Nature Methods | 何爱彬/舒绍坤团队合作开发单细胞药物基因组靶点检测新技术解析表观耐药机制

scEpiChem提供了一个全面的高通量分析框架,捕捉了传统bulk分析无法实现的小分子药物反应的细胞异质性特征。

2024-07-20

Cell重磅:章冰/高强团队等利用泛癌蛋白基因组学分析,绘制癌症治疗靶点全景图

临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)对1000多个前瞻性收集的、未经治疗的原发肿瘤进行了蛋白质组学和基因组学特征分析,涵盖了10种癌症类型,其中许多肿瘤还配有相应的正常组织样本。

2024-06-26

Science:利用人工智能确定人类基因组转录起始的序列基础

Puffin程序显示,根据这些序列模式的排列方式,它们可以激活或抑制基因的转录。它还能预测这些序列模式的排列如何引导 RNA 聚合酶优先转录 DNA 的单链或同时向相反方向转录两条链。

2024-05-26

Nat Neurosci:科学家构建单细胞表观基因组图谱,揭示调控细胞命运的关键“开关”

本研究中构建的人类神经类器官发育的单细胞表观基因组图谱,为深入了解人类细胞命运选择提供了宝贵的参考蓝本。

2024-07-22

Nature Genetics | 癌症基因组学的新突破:探索复杂基因型与表型关联的组合遗传策略

该研究中研究人员通过将编码癌症相关基因事件的条形码慢病毒文库高效地随机引入到原代上皮细胞中,并将这些细胞移植到小鼠中以选择肿瘤原克隆。

2024-03-06

Redox Biology:HIF-1α在促进胚胎合子基因组激活中的关键作用

本研究为氧浓度对着床前遗传或表观遗传编程和重编程事件的影响提供了新的理解。

2024-04-23

Science:科学家开发出能帮助理解人类基因组中转录起始的特殊机器学习模型

研究人员开发了一种名为Puffin的机器学习程序,当分析了数以万计已知的人类启动子数据后,这种新型程序就能确定其由三种类型的序列模式所组成,即基序、启动子和三核苷酸(trinucleotides)。

2024-05-27

Nature:新研究揭示血液生物标志物与疾病之间存在许多关联,并确定了 400 多个影响代谢调节的基因组区域

这项新的研究有力地证明了新研究方法——既包括代谢分析,也包括遗传分析及其多学科组合对于发展科学和揭示错综复杂的自然界的核心重要性。

2024-03-11

Nature Genetics | 多维度解析复杂人类疾病:整合群体遗传学、干细胞生物学与细胞基因组

hPS细胞作为一种细胞模型,在评估人类遗传变异对不同谱系、发育状态和细胞类型的影响方面显示出巨大的潜力。

2024-05-22

首次绘制出酵母基因组编码蛋白在完整细胞周期中的精密运动与分布图谱

酵母作为真核生物的理想模型,其独特优势在于能够让我们观测到大规模的生物学过程,这是在其他更简单或更复杂的生物体中难以实现的。通过研究酵母细胞周期,有望深化对人类细胞周期机制的理解。

2024-05-02