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空间组学数据解析肿瘤微环境的异质图学习方法

该研究提出了名为stKeep的新模型。该模型构建了三种不同节点即细胞/spot、基因和肿瘤区域以及八种连接关系的异构图模型,用于刻画肿瘤微环境。

2024-07-02

Science:神经与免疫的跨界对话:TRPV1神经元如何“遥控”肠道T细胞

本文研究人员建立了一个基于DREADD分子靶向表达的系统性筛选,以检测外周神经元亚型的激活如何调节免疫系统和肠道微生物组。

2024-09-13

Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱:CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化

CalicoST算法的核心优势在于其能够从SRT数据中精确推断等位基因特异性拷贝数变异(allele-specific CNAs)。

2024-11-23

Cancer Cell:颜鹏泽等揭示Midkine是乳腺衰老和肿瘤发生的驱动因素

该研究不仅揭示了Midkine在衰老及乳腺肿瘤发生中的重要作用,还为理解衰老相关肿瘤的发病机制和发展新的干预策略奠定了基础,具有重要的生物学和临床应用价值。

2024-10-06

Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱,CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化

CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异,还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹,绘制出肿瘤演化的“进化地图”。

2024-11-10

Mol Cell:涂镇波等揭示转座元件衍生基因在肿瘤中的关键作用机制

本研究阐明了POGK通过其KRAB结构域与转录抑制因子TRIM28结合,形成转录抑制复合物,从而抑制小核糖体亚基RPS16和RPS29的基因转录。

2024-11-25

Nat Aging:揭示衰老损伤机体中CD8+ T细胞抗肿瘤活性背后的分子机制

本文研究揭示了衰老在损伤CD8+ T细胞抗肿瘤免疫反应中的作用以及其背后的分子机制。

2024-12-04

Cancer Cell :颜鹏泽等揭示Midkine是乳腺衰老和肿瘤发生的驱动因素

该研究不仅揭示了Midkine在衰老及乳腺肿瘤发生中的重要作用,还为未来的临床研究提供了新的视角与可能性。

2024-10-08

Cell | 肿瘤细胞状态和异质性的发育约束模型

该研究提出了肿瘤细胞状态和异质性的“发育约束模型”,该模型将肿瘤异质性的起因与发育限制统一起来,为理解肿瘤细胞行为提供了新的见解。

2024-06-19

北京大学健康科学中心的研究者们揭示了抑制FAK是增强放射治疗肿瘤免疫的佐剂

利用放射治疗的全身性抗肿瘤效应,可以促进原发肿瘤的有效治疗,消除转移灶或不能直接照射的灶。然而,RT在患者中发生全身抗肿瘤作用的情况极为罕见。

2024-01-29