Science Advances：揭示基因组“无用”序列稳定染色质三维结构及细胞稳态机制
人类基因组中的非编码序列在多种生物学过程中发挥着至关重要的作用，如非编码RNA、启动子、增强子和转座子等。作为在基因组中占比约98%的非编码区域，仍有大量是功能未知的，这些曾被认为是基因组中“垃圾”的区域，已被逐渐证实存在重要功能。基因组的三维结构会影响基因的转录调控或其他细胞生命活动，然而，除了研究较多的增强子-启动子成环所形成的三
Science子刊：解析出HIV病毒衣壳的三维结构，有助于开发出靶向HIV衣壳的抗病毒药物
在一项新的研究中，研究人员利用一种基于电子断层成像和子断层扫描图平均化的新技术，解析出HIV衣壳单独存在时和与宿主因子结合在一起时的结构。他们还利用从电子断层成像获得的信息建立了整个HIV衣壳的原子模型，他们认为这可能作为开发靶向HIV衣壳的抗病毒药物的蓝图。
The Innovation：研究解析处于复杂生物环境中的蛋白质机器三维结构
近日，中国科学院生物物理研究所章新政课题组在The Innovation上在线发表题为Determining structures in a native environment using single-particle cryo-electron microscopy images的研究论文。该工作是继2018年开发的分块重构算法
三维粒子追踪领域取得进展
在生命科学、药物研发等领域，纳米粒子定位及追踪技术具有广泛需求。外泌囊泡、病毒和纳米药物载体是生物体内常见的纳米粒子，它们的动态转运是实现胞间通讯、侵袭感染、药物递送等功能的重要过程。因此，实时捕捉这些粒子的胞内外运动在探寻生命活动基本规律及药物转化研究中具有重要意义，这对于阐明疾病发病、病毒动态侵染宿主细胞机制等关键科学问题，以及推
Science：解析出人脑细胞受体GPR158的三维结构图，有助于开发治疗抑郁症和焦虑症的方法
在一项新的研究中，来自美国斯克里普斯研究所的研究人员利用超冷单粒子电子显微镜（低温电镜）以大约十亿分之一米的分辨率解析出一种名为GPR158的不寻常的脑细胞受体及其与一组介导其活性的蛋白结合在一起时的原子结构图。
研究报道红藻藻胆体-光系统II复合体的原位冷冻断层三维结构
海洋藻类为适应海底微弱的光环境进化出不同于高等植物的捕光系统。藻胆体(phycobilisome， PBS)则是蓝藻和红藻位于类囊体膜上的色素-蛋白超分子捕光复合体， 具有高效捕获传递光能的作用。藻胆体捕获的光能进一步传递给镶嵌于类囊体膜内的光系统II（photosystem II， PSII），在这个重要场所进行电荷分离，利用光能分
Genes & Development：发表增强子eRNA调控三维基因组重要研究进展
增强子是人类基因组中一大类非常重要的顺式调控元件，能够参与染色质的空间折叠和基因的表达调控。在人类基因组中存在着成千上万的增强子，它们在组织器官发育过程的基因调控中起到重要作用。上世纪90年代，研究者发现增强子能够转录出RNA。直至2010年，增强子转录出的RNA才被命名为eRNA。在eRNA刚被发现的时候，它们被当成不具有生物学功能的转录“副产物”。随着研
Science封面重磅：新型AI算法准确预测RNA三维结构
近日，美国斯坦福大学在读博士生 Stephan Eismann 和 Raphael Townshend 在计算机副教授 Ron Dror 的指导下，利用目前先进的神经网络技术，成功开发出了一种全新 RNA 三维结构预测模型——ARES。与其他传统 AI 算法不同，ARES 的结构框架并不是针对 RNA 结构设计，而是针对原子结构设计的
Science：利用新型机器学习技术准确预测蛋白和RNA的三维结构
美国斯坦福大学博士生Stephan Eismann和Raphael Townshend在该大学计算机科学副教授Ron Dror的指导下，利用巧妙的新型机器学习技术，开发出一种通过计算预测准确结构来克服这一问题的人工智能算法。最值得注意的是，即使只从少数已知结构中学习，他们的方法仍然成功，这使得它适用于那些结构最难通过实验确定的分子类型。