Cell：利用交互式的、体验式的现实生活模拟程序来预防疫情爆发
来源：本站原创 2020-09-15 23:53
2020年9月15日讯/生物谷BIOON/---2015年，一组疾病爆发建模专家与教育工作者一起创建了Operation Outbreak，这是一个旨在向高中生和大学生教授应对大流行病基本知识的教育平台和模拟程序。该程序是开源和免费提供的，旨在用不同的变量（比如R0和传播模式）模拟疾病爆发，并在真实的人类行为背景下生成数据。它包括一个基于蓝牙的应用程序（ap
2020年9月15日讯/生物谷BIOON/---2015年，一组疾病爆发建模专家与教育工作者一起创建了Operation Outbreak，这是一个旨在向高中生和大学生教授应对大流行病基本知识的教育平台和模拟程序。该程序是开源和免费提供的，旨在用不同的变量（比如R0和传播模式）模拟疾病爆发，并在真实的人类行为背景下生成数据。它包括一个基于蓝牙的应用程序（app），通过记录手机之间的传播事件来进行接触者追踪。近期，Cell期刊发表一篇标题为“Preventing outbreaks through interactive, experiential real-life simulations”的评论文章，重点介绍了这些细节。
当时佛罗里达州的中学教师Todd Brown在杂志上读到美国布罗德研究所计算生物学家Pardis Sabeti的简介后与她进行了联系，在此之后便想要开发Operation Outbreak。当时，他和他的学生们正在研究西非正在爆发的埃博拉疫情，并正在开发一种如何模拟这种病毒传播的模拟程序。
随着他们继续合作，Sabeti和她的团队，包括Andrés Colubri（当时她实验室里的一名计算科学家），开始研究波士顿大学校园里爆发的腮腺炎。他们很快就萌生了构建一款通过蓝牙 “传播”病毒的教育应用程序的想法。就在2019年12月，他们正在模拟一种传播方式与SARS-CoV-2相似的病毒的爆发。
Colubri（如今在马萨诸塞大学医学院任职）说，“我们决定使用一种类似SARS-CoV的病毒，这是因为它在许多大流行病研究人员的关注名单上一直名列前茅。为了使得这种模拟更具挑战性，我们加入了无症状传播的元素。这是一个自然的担忧，会进一步提高大流行的可能性。”
今年夏天，随着COVID-19大流行病的持续蔓延，Operation Outbreak被推广到芝加哥市的2000名学生中，这些学生作为“社会隔离大使（social distancing ambassador）”参与芝加哥青少年暑期实践（One Summer Chicago）项目。这些参与者使用这种应用程序追踪和跟踪行为，了解“感染”如何在城市的不同地区传播。
Brown说，“从学术和体验式学习的角度来看，这个平台和课程非常灵活。我们试图将教育游戏化，这样玩家的行为和决定不仅会影响到他们自己，也会影响到他们所在的整个群体。”
这种模拟程序包括了我们日常生活中熟悉的一些因素，比如测试能力的限制和个人防护设备（PPE）的短缺。该程序还提供了模拟当前流行病或未来流行病中可能出现的其他因素的能力，比如可能使得诊断复杂化的其他流行病毒。
Brown说，“我们正处于世界历史上最独特的情况之一，这是因为我们能够让学生参与进来。当一些事情直接影响到他们和他们的家庭时，孩子们会更有动力去学习。这是后代了解感染如何传播和识别预警信号的机会。”
Sabeti说，“我希望我们能传达这样一个信息：我们不必等到下一次大流行才知道如何应对。最终，我们可以精致地模拟病毒的每一个方面以及它们的传播方式，甚至是我们通过疫苗、防护装备和诊断来加以应对的方式。”
这些研究人员已经整理出一套可扩展的课程，包括一本教科书和一系列教育视频，可以在美国全国各地的学校进行整合。这些由慈善机构资助的材料是开源的，可以免费使用。（生物谷 Bioon.com）
参考资料：
1.Andrés Colubri et al. Preventing outbreaks through interactive, experiential real-life simulations. Cell, 2020, doi:10.1016/j.cell.2020.08.042.
2.Operation Outbreak simulation teaches students how pandemics spread
https://medicalxpress.com/news/2020-09-outbreak-simulation-students-pandemics.html
图片来自Cell, 2020, doi:10.1016/j.cell.2020.08.042。
当时佛罗里达州的中学教师Todd Brown在杂志上读到美国布罗德研究所计算生物学家Pardis Sabeti的简介后与她进行了联系，在此之后便想要开发Operation Outbreak。当时，他和他的学生们正在研究西非正在爆发的埃博拉疫情，并正在开发一种如何模拟这种病毒传播的模拟程序。
随着他们继续合作，Sabeti和她的团队，包括Andrés Colubri（当时她实验室里的一名计算科学家），开始研究波士顿大学校园里爆发的腮腺炎。他们很快就萌生了构建一款通过蓝牙 “传播”病毒的教育应用程序的想法。就在2019年12月，他们正在模拟一种传播方式与SARS-CoV-2相似的病毒的爆发。
Colubri（如今在马萨诸塞大学医学院任职）说，“我们决定使用一种类似SARS-CoV的病毒，这是因为它在许多大流行病研究人员的关注名单上一直名列前茅。为了使得这种模拟更具挑战性，我们加入了无症状传播的元素。这是一个自然的担忧，会进一步提高大流行的可能性。”
今年夏天，随着COVID-19大流行病的持续蔓延，Operation Outbreak被推广到芝加哥市的2000名学生中，这些学生作为“社会隔离大使（social distancing ambassador）”参与芝加哥青少年暑期实践（One Summer Chicago）项目。这些参与者使用这种应用程序追踪和跟踪行为，了解“感染”如何在城市的不同地区传播。
Brown说，“从学术和体验式学习的角度来看，这个平台和课程非常灵活。我们试图将教育游戏化，这样玩家的行为和决定不仅会影响到他们自己，也会影响到他们所在的整个群体。”
这种模拟程序包括了我们日常生活中熟悉的一些因素，比如测试能力的限制和个人防护设备（PPE）的短缺。该程序还提供了模拟当前流行病或未来流行病中可能出现的其他因素的能力，比如可能使得诊断复杂化的其他流行病毒。
Brown说，“我们正处于世界历史上最独特的情况之一，这是因为我们能够让学生参与进来。当一些事情直接影响到他们和他们的家庭时，孩子们会更有动力去学习。这是后代了解感染如何传播和识别预警信号的机会。”
Sabeti说，“我希望我们能传达这样一个信息：我们不必等到下一次大流行才知道如何应对。最终，我们可以精致地模拟病毒的每一个方面以及它们的传播方式，甚至是我们通过疫苗、防护装备和诊断来加以应对的方式。”
这些研究人员已经整理出一套可扩展的课程，包括一本教科书和一系列教育视频，可以在美国全国各地的学校进行整合。这些由慈善机构资助的材料是开源的，可以免费使用。（生物谷 Bioon.com）
参考资料：
1.Andrés Colubri et al. Preventing outbreaks through interactive, experiential real-life simulations. Cell, 2020, doi:10.1016/j.cell.2020.08.042.
2.Operation Outbreak simulation teaches students how pandemics spread
https://medicalxpress.com/news/2020-09-outbreak-simulation-students-pandemics.html
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